Управление СПЧ осуществляется системой управления, регулирования, защит и автоматики типа Unicon. Система Unicon представляет собой масштабируемый комплекс блоков и ячеек управления, построенный на основе современных быстродействующих сигнальных процессоров (Texas Instruments), быстродействующих микросхем программируемой логики (Altera) и оптоволоконной пересылки сигналов управления и измеренных величин (Avago). Основным элементом системы Unicon является микропроцессорный блок управления, представляющий собой блочную универсальную конструкцию (БУК). В состав блока управления входит объединяющая кросс-плата, в которую вставляются ячейки управления.